本系創立於民國 81 年，原為五年制進修學士班，自 90 學年度起更改為四年制，提供高中畢業生及同等學歷社會人士進修。本系於89 學年度增設碩士班，目標在培育具備資訊系統設計分析能力，並充分利用資訊管理與通訊技術的資訊經營人才。從 92 學年度起進修學士班改制成立大學日間部，研究所部分開始招收碩士在職專班(EMIS)研究生。 

為培育企業數位轉型人才，奉教育部核准，事業經營學系與資訊經營學系將於2025年合併，更名為「事業與資訊經營學系」，新系網為https://bim.ttu.edu.tw/